Молекулярные исследования генотипов микобактерий туберкулеза исходно и в последующем.

BMC Инфекционные болезни, том 23, Номер статьи: 566 (2023 г.) Цитировать эту статью

Подробности о метриках

Эпидемия туберкулеза (ТБ) остается серьезной глобальной проблемой здравоохранения, и Эсватини не исключен. В нашем исследовании изучались циркулирующие генотипы у Эсватини и сравнивались их исходный уровень (начало лечения) и последующее наблюдение во время лечения туберкулеза.

Триста девяносто (n = 390) участников были проспективно включены в исследование из специализированных клиник, и пациенты, соответствующие критериям включения, были включены в исследование. В общей сложности 103 участника предоставили образцы в начале исследования и при последующем наблюдении в течение шести месяцев. Штаммы микобактерий туберкулеза (M.tb) выявляли с помощью анализа GeneXpert® MTB/RIF (Cephied, США) и микроскопии Циля-Нильсена (ZN) соответственно в исходные и последующие моменты времени соответственно. 206 собранных образцов были обеззаражены и культивированы на системе культивирования микобактерий BACTEC™ MGIT™ 960 (Becton Dickinson, США). Тестирование на чувствительность к лекарственному средству проводилось как в исходный, так и в последующие моменты времени. Сполиготипирование проводили как на исходных, так и на контрольных штаммах после выделения ДНК.

Устойчивость по крайней мере к одному препарату первого ряда была обнаружена выше в исходном состоянии по сравнению с образцами последующего наблюдения, при этом у большинства из них развился туберкулез с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ). Всего выявлено четыре линии и двадцать генотипов. Распределение линий варьировалось в разных регионах Эсватини. Евро-американское происхождение было наиболее распространенным - 46,12% (95/206), за ним следовала восточноазиатская линия с 24,27% (50/206); Индо-Океанский - 9,71% (20/206) и Центрально-Азиатский - 1,94% (4/206). Кроме того, была обнаружена высокая доля генотипа Пекин - 24,27% (50/206) и генотипа S - 16,50% (34/206). Генотип Пекин преобладал в контрольных образцах, собранных в регионе Манзини, с 48,9% (23/47) (p = 0,001). У значительной части контрольных образцов развился МЛУ-ТБ (p = 0,001), при этом в большинстве контрольных образцов основным генотипом был Пекин (p < 0,000).

Эсватини имеет высокое генотипическое разнообразие M.tb. У значительной части участников, инфицированных туберкулезом, в контрольных образцах был обнаружен пекинский генотип, связанный с МЛУ-ТБ, что указывает на передачу инфекции в масштабах сообщества.

Отчеты экспертной оценки

Туберкулез (ТБ) остается серьезной глобальной проблемой здравоохранения, вызывающей ухудшение здоровья миллионов людей каждый год [1]. В Королевстве Эсватини уровень регистрации и заболеваемости туберкулезом в последнее десятилетие неуклонно снижался: с пикового уровня заболеваемости 1190 на 100 000 населения в 2009 году до низкого уровня заболеваемости 329 на 100 000 населения в 2018 году [2]. Уведомления о лекарственно-устойчивом туберкулезе (ЛУ-ТБ) аналогичны уведомлениям о лекарственно-чувствительном туберкулезе за тот же период; однако до недавнего времени ЛУ-ТБ не отслеживался должным образом в большинстве противотуберкулезных программ в регионе Африки к югу от Сахары [3]. Доля лиц, у которых во время лечения развивается лекарственно-устойчивый туберкулез, в том числе больных туберкулезом с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ-ТБ), за последние годы в Эсватини увеличилась. Важно установить, вызвана ли резистентность высокой степенью передачи вируса в обществе, или она возникает denovo из-за неадекватного лечения, или же она вызвана обоими факторами. МЛУ-ТБ, который определяется как устойчивость, по крайней мере, к препаратам изониазида (ИНГ) и рифампицину (РИФ), используемым для лечения туберкулезных заболеваний, труднее диагностировать и лечить и связан с неблагоприятными исходами [4]. Более того, ЛУ-ТБ не только свидетельствует о неэффективности пациентов и программ по борьбе с туберкулезом, но и является более дорогостоящим для обоих случаев [5]. Эсватини стремится положить конец туберкулезу, а тогдашний премьер-министр еще в 2011 году объявил эту болезнь чрезвычайной ситуацией в стране [6]. Целью исследования является характеристика генотипов Mycobacterium Tuberculosis (M.tb), полученных от обычных пациентов, проходивших лечение в четырех основных региональных центрах Королевства Эсватини.

Клинические лаборатории Эсватини используют микроскопию мазков мокроты и анализ GeneXpert® MTB/RIF (Cephied, США) для диагностики туберкулеза у предполагаемых пациентов. Кроме того, культуральная и лекарственная чувствительность обнаруженных образцов туберкулеза определяется с использованием тонкослойного агара, методов системы Левенштейна-Йенсена и Bactec MGIT™ TB. Важно, чтобы выявление штамма M.tb было идентифицировано для разработки эффективных стратегий борьбы с туберкулезом. Генотипирование штаммов циркулирующих генотипов туберкулеза поможет понять молекулярную эпидемиологию и закономерности передачи. Документально подтверждены достижения в области молекулярных эпидемиологических методов, которые, как сообщается, расширяют возможности исследования и понимания эпидемии туберкулеза [7]. Сполиготипирование остается экономически эффективным методом в регионах с ограниченными ресурсами, данные которого хранятся в международной базе данных. Примечательно, что молекулярные методы генотипирования традиционно не используются в условиях ограниченных ресурсов, таких как Эсватини.